停业整顿和限期整改,最大的区别在于是否停止生产经营,前者是停止生产经营进行整改,整改到位后,经检查合格后,再恢复生产经营;后者是不停止生产经营,同时进行整改,但在一定期限内必须达标,否则,就是停业整顿或责令停产停业。 停业整顿是行政强制措施,不是行政处罚。
法律依据：《中华人民共和国行政处罚法》第九条
行政处罚的种类：
（一）警告、通报批评；
（二）罚款、没收违法所得、没收非法财物；
（三）暂扣许可证件、降低资质等级、吊销许可证件；
（四）开展生产经营活动、责令停产停业、责令关闭、从业；
（五）行政拘留；
（六）法律、行规规定的其他行政处罚。